造成菌丝发好后迟迟不出菇的原因有很多，可以从以下几个方面逐一排查，寻找具体原因，找出解决问题的方法。
1、了解菌株特性和质量 若菌株退化、出菇能力弱，稍受外界因素影响即会迟迟不出菇，减产甚至绝收。另外，要考虑食用菌品种的特性，早熟型品种在发菌完成后即可以开袋出菇，中熟型和后熟型品种有一段后熟期，需静置一段时间，等原基出来后方可开袋出菇。
2、品种对温度的敏感性
有些品种需要一定的温差刺激或者搔菌刺激，如有些香菇、秀珍菇需要低温刺激才能出菇，蛹虫草栽培过程中一般需要搔菌处理才会出草旺盛。对于需要温差处理的品种应在发满菌后进行温差刺激，促使出菇。
3、温度不适
菌丝在培养料内长透之后，如室温是在平菇品种适宜的温度范围之内，便很快出现菇蕾。如温度过高、过低都会抑制原基形成。
处理方法：
①针对各品种对温度的要求，适时播种；
②破块灌水，即菌丝长满料后，破块灌水3~5天后，在缝隙处有大量原基形成。
③加压。当菌丝生长到一定程度，在菌床表面放若干小鹅卵石，平菇很快从石头缝隙处长出。
④曝光。利用平菇的光效应，适时进行光照，可促进子实体形成
4、菌床湿度
菌床通风不良，或不适当施用氮素营养，都会造成菌丝徒长，料面出现大量气生菌丝，倒伏后形成厚菌被—菌膜，会影响到原基的分化。处理方法是搔菌，即在菌膜出现后，应用铁器在培养料表面全面或打方格进行耙动，除去老菌丝（膜），再压实，同时注意保温保湿，刺激子实体形成。
5、氧气
食用菌菇房内要有适宜的氧气含量，氧气含量太低不利于子实体的生长，容易造成不出菇或者畸形菇现象。必要时在菇房安装排气扇，定时换风，促使出菇。
